No início da década de 1980, jovens militares apoiaram a derrubada do regime corrupto do General Sangule Lamizana. Sankara até recebeu o cargo de Ministro da Informação no novo governo, mas rapidamente passou a se opor às novas autoridades. Saye Zerbo, que assumiu o poder, apenas fortaleceu o regime autoritário e os esquemas de corrupção do seu antecessor. Sankara foi preso diversas vezes por criticar as autoridades, mas sua popularidade salvou o carismático capitão de repressões mais severas. Dois anos depois, como resultado de outro golpe, Jean-Baptiste Ouedraogo tornou-se o presidente do Alto Volta, que decidiu usar o capital político de Sankara e nomeou o desgraçado capitão como primeiro-ministro. Na sua nova função, Sankara reuniu-se com Fidel Castro, o presidente moçambicano de esquerda Samora Machel e o líder do Governo Popular Revolucionário de Granada, Maurice Bishop.
Sankara logo começou a apelar abertamente a medidas concretas para libertar o país da dominação europeia. A sua atividade preocupou o presidente francês, François Mitterrand. Na Primavera de 1983, o conselheiro do líder francês para assuntos africanos, o seu filho Jean-Christophe Mitterrand, chegou ao Alto Volta. O diplomata apelou a Ouedraogo para que tomasse medidas contra o perigoso primeiro-ministro. Sankara foi afastado do cargo e colocado em prisão domiciliar.
Mas tais ações provocaram agitação popular, tendo como pano de fundo os associados de Sankara que organizaram um golpe. Em agosto de 1983, soldados leais e oficiais da guarnição da capital ocuparam instalações estrategicamente importantes. Completamente privado de apoio popular, Ouedraogo não conseguiu deter os rebeldes. Sankara foi libertado e nomeado presidente do Comitê Revolucionário Nacional.
Infraestrutura, árvores e vacina
Em 1984, Sankara renomeou o país como Burkina Faso, que significa “Terra de Pessoas Honestas” nas línguas locais. O novo emblema estatal apresenta uma versão africana da foice e do martelo – um rifle de assalto Kalashnikov e uma enxada.
Sankara cortou os salários dos altos funcionários e substituiu todos os carros Mercedes dos funcionários públicos pelo Renault 5 – o carro mais barato que então se encontrava no país. O próprio Sankara morava em uma modesta casa de tijolos, ia de bicicleta para o trabalho, usava apenas roupas de algodão feitas localmente e proibia a instalação de ar condicionado em seu escritório por ser um luxo inacessível para as pessoas.
Em Novembro de 1984, a maior campanha de vacinação do país contra doenças infecciosas foi implementada pelo governo Sankara. Com a ajuda de voluntários cubanos, 2,5 milhões de crianças foram vacinadas em Burkina Faso e nas zonas fronteiriças dos países vizinhos. As taxas de mortalidade infantil, anteriormente as mais elevadas do mundo (280 mortes por 1.000 nascimentos), caíram para metade. O governo de Sankara foi o primeiro na África a reconhecer oficialmente a epidemia da AIDS. A distribuição de contraceptivos e a educação sexual foi iniciado em Burkina Faso.
Sankara iniciou a alfabetização em larga escala nas línguas locais. As mulheres receberam direitos iguais aos dos homens e tiveram acesso à educação. Eles foram incentivados a trabalhar no governo e ingressar no exército. Práticas como a circuncisão feminina e o casamento forçado foram proibidas.
Uma das primeiras decisões de Sankara foi privar os líderes tribais dos seus privilégios e terras, bem como abolir o pagamento de tributos a eles e o trabalho obrigatório para os camponeses. As parcelas de terra que pertenciam aos proprietários feudais foram redistribuídas em favor dos camponeses que as trabalhavam. O governo começou a construir barragens e reservatórios.
Como resultado da reforma agrária, em três anos a produção do trigo aumentou de 1.700 para 3.800 kg por hectare. A produção de algodão e têxteis aumentou acentuadamente. A proibição da importação de frutas e vegetais incentivou os comerciantes a fornecerem os seus próprios produtos ao mercado interno do país. Foi criada uma rede nacional de lojas para distribuição. Antes disso, o pobre país tropical importava maçãs da França por algum motivo obscuro, o qual Sankara ficou perplexo. O ex-relator da ONU, Jean Ziegler, disse que as reformas de Sankara causaram um verdadeiro boom agrícola: “o problema da fome neste país é coisa do passado”.